萨迦派俗称花教。当宁玛派僧人大力弘法的时候，著名僧人贡却杰布（1034-1102）在后藏仲曲河谷一片呈灰白色土质的地方，建立起一座“白宫”。贡却杰布以此为基地，传教弘法，开创了一个新的教派“萨迦派”。
萨迦，藏语意为“白土”，建筑在那片白色土地上的寺庙也就被称为萨迦寺。因为寺庙围墙涂有象征文殊、观音和金刚手的红、白、黑三色花纹，所以萨迦派又俗称为“花教”。
萨迦派的教主由款氏家族世代相传。有血统、法统两支传承。萨迦派不禁止娶妻，但规定生子后不再接近女人。
位于后藏的萨迦寺，其佛殿后的藏经库，所藏一万余部佛经、佛典，是八思巴时期集中了卫、藏、康三地区的缮写家用金汁、银汁、朱砂、宝石和墨汁精工抄写而成的，堪称佛教中的珍宝。萨迦寺另有一部“方经”，长、宽各有一米，上下均用夹板保护着，全部用金汁写成，更被视为宝中之宝。整个萨迦寺共藏佛教经藏四万多卷，其中还包括大量的“贝叶经”。难怪充满智慧之光的萨迦寺，有人称它为“第二敦煌”。
萨迦派于公元1729年在四川德格贡钦寺所设立的德格印经院，是藏区最著名的印经院。专门刊刻藏传佛教经书、各宗派重要著述、历法和医学等千余种典籍，对保护藏传佛教文化起了重要作用。
